Verstoring van de darmbalans
Een voorbeeld hiervan is de productie van toxines en carcinogenen bij een proteolytische fermentatie van dierlijke eiwitten waarbij ammoniak, fenolen, indolen en amines ontstaan. Een verstoring van de balans van de darmmicrobiota (ook wel dysbiose genoemd), is geassocieerd met verschillende aandoeningen, waaronder inflammatoire darmaandoeningen en metabole ziekten, zoals diabetes. Er is een aantal factoren die van invloed zijn op de samenstelling van de darmmicrobiota, waaronder dieet, leeftijd, roken, lichaamsbeweging, medicatie en stress.